张学文国医大师研究院是在2010年成立的国医大师张学文学术思想与临床经验研究所的基础上，于2016年10月12日经学校校长办公会研究同意，党委会议审定而成立。研究院是学校直属的科研机构，下设文献研究所、临床研究所、文化研究所、办公室和陕西省中医脑病重点实验室。现有专、兼职研究人员51名。其中国医大师1人，省级名中医3人，二级教授3人，三级教授2名。中医师承博士后导师1人，中医师承博士导师2人，兼职博士导师2人，陕西省教学名师2人。本研究团队人员整体素质高、学历高、职称高、理论知识扎实、科研经验丰富。研究人才分别来自于中医专业、中西医结合专业、神经生物、药理、病理等专业，学缘结构合理。

研究院围绕国医大师张学文教授“脑当为脏论”学术思想，根据其“颅脑水瘀证”、痰瘀交夹”等学术理论，已组建“中医脑系疑难病证古今文献整理及国医大师学术思想体系研究团队”、“中医脑病痰瘀类证诊疗标准及适宜技术推广应用研究团队”、“中医脑病痰瘀类证证候机理及优势病证的中医药疗效机制研究团队”、“国医大师医学人文思想及其传承传播研究团队”四个核心团队。力争打造国内一流的中医脑病理论及应用研究国际化创新团队，引领中医脑病学术发展。团队成员80%以上以中医脑病的教学、临床、科研为主要工作重心；形成的中医脑病学术团队成员要覆盖全国70%以上省级行政区，正争取与美国波士顿、纽约等其他城市，英国、德国、马来西亚、瑞士、法国等欧美国家加强合作，传播中医药文化，建造一支能以中国陕西为中心，覆盖全球的国内权威中医药脑病团队。

研究院脑病团队围绕国医大师张学文教授的学术思想、临床经验、养生保健、医德医风等领域进行传承创新，开展科学研究，以发挥国医大师的学术引领和辐射作用。联合相关学科进行技术攻关，促进研究成果转化，培育重大科技成果。推动脑病学科建设和人才队伍建设，提高人才培养质量，促进国内一流高水平中医药大学建设，为国家中医药事业的传承发展和中医人才的培养不断拼搏，砥砺前进。